Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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COPS7AQ9UBW8 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
COPS7AQ9UBW8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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