Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GDE1Q9NZC3 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GDE1Q9NZC3 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms