Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
SMG1Q96Q15 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMG1Q96Q15 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms