| UPP1 | Q16831 | AC073626.1-201 | ENST00000415146 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL445123.1-201 | ENST00000422023 | 446 nt | TSL 2 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNRPEP9-201 | ENST00000436794 | 238 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND1P34-201 | ENST00000438556 | 671 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL21P2-201 | ENST00000440049 | 481 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL118523.1-201 | ENST00000444436 | 480 nt | TSL 3 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | Z96811.1-201 | ENST00000445880 | 108 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC027673.1-201 | ENST00000456245 | 405 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU7-182P-201 | ENST00000459009 | 62 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC104806.1-201 | ENST00000508720 | 308 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP281-201 | ENST00000516504 | 135 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC020661.3-201 | ENST00000558101 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009269.3-201 | ENST00000558429 | 472 nt | TSL 5 BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 2.54 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | DYNC2H1-202 | ENST00000375735 | 13678 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | IL33-201 | ENST00000381434 | 2641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | CACNB4-228 | ENST00000636598 | 7808 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-606P-201 | ENST00000384721 | 111 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | PPP3R1-202 | ENST00000409377 | 684 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP425-201 | ENST00000410336 | 112 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP111-201 | ENST00000411386 | 101 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP000473.1-201 | ENST00000413645 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR51A5P-201 | ENST00000415429 | 942 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL358234.1-201 | ENST00000421132 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO3P30-201 | ENST00000426425 | 670 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL356320.1-201 | ENST00000429616 | 163 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | GYPB-201 | ENST00000429670 | 239 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
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| UPP1 | Q16831 | PSPHP1-201 | ENST00000450062 | 261 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC004888.1-201 | ENST00000450480 | 547 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL109763.1-201 | ENST00000455391 | 461 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU7-63P-201 | ENST00000459054 | 62 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | SRRM1P2-201 | ENST00000464531 | 1192 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RN7SL499P-201 | ENST00000481141 | 276 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC233702.1-201 | ENST00000482905 | 502 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC139453.3-201 | ENST00000493276 | 369 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009901.1-201 | ENST00000506703 | 541 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC098591.2-201 | ENST00000510152 | 315 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC009646.1-201 | ENST00000510455 | 318 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNA5SP503-201 | ENST00000517047 | 117 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | RANP3-201 | ENST00000530970 | 276 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL355076.2-202 | ENST00000553754 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL049869.2-201 | ENST00000556634 | 365 nt | TSL 2 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGB1P14-201 | ENST00000557424 | 591 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | PWRN1-205 | ENST00000565295 | 465 nt | TSL 3 BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTCO3P13-201 | ENST00000577757 | 781 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC008739.2-201 | ENST00000597006 | 317 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC174048.1-201 | ENST00000603389 | 144 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL670379.4-201 | ENST00000605279 | 254 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC126118.1-201 | ENST00000607744 | 628 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC110079.1-202 | ENST00000635213 | 138 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | GYPB-216 | ENST00000638448 | 363 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC027514.1-201 | ENST00000588561 | 1603 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC010680.1-201 | ENST00000590024 | 3590 nt | BASIC | 2.53 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC022336.2-201 | ENST00000568966 | 2538 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | KERA-201 | ENST00000266719 | 2162 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-884P-201 | ENST00000363889 | 107 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | SNORA4.3-201 | ENST00000365564 | 137 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-116P-201 | ENST00000384042 | 109 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-198P-201 | ENST00000384258 | 104 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU2-68P-201 | ENST00000410878 | 191 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.619-201 | ENST00000410951 | 90 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC007064.1-201 | ENST00000412238 | 351 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | USP9YP6-201 | ENST00000413550 | 854 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL031779.1-201 | ENST00000415663 | 330 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL135786.1-201 | ENST00000415892 | 214 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL138737.1-202 | ENST00000418834 | 876 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC133106.1-201 | ENST00000419029 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC016710.1-201 | ENST00000421326 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL162400.2-201 | ENST00000427547 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AP001117.1-201 | ENST00000428205 | 609 nt | TSL 2 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS12P2-201 | ENST00000439728 | 269 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL39P40-201 | ENST00000445481 | 146 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC104688.1-201 | ENST00000447158 | 419 nt | TSL 3 BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
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| UPP1 | Q16831 | FDX1P2-201 | ENST00000450769 | 375 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPS27AP9-201 | ENST00000477681 | 438 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC019235.1-201 | ENST00000503847 | 207 nt | BASIC | 2.52 | □□□□□ -2.01 | | |