Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CDKN3Q16667 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms