Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SGCBQ16585 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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