Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SSX1Q16384 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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