Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
E2F4Q16254 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
E2F4Q16254 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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