Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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