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| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD3E-201 | ENST00000362899 | 217 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-395P-201 | ENST00000365662 | 106 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TSHB-202 | ENST00000369517 | 474 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-297P-201 | ENST00000384636 | 107 nt | BASIC | 1.98 | □□□□□ -2.09 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02165-201 | ENST00000563061 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC2194-202 | ENST00000567624 | 506 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092378.2-202 | ENST00000569328 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC015813.2-201 | ENST00000578794 | 711 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL139286.2-201 | ENST00000606838 | 396 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC023490.1-201 | ENST00000614584 | 375 nt | TSL 2 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP001506.1-201 | ENST00000615444 | 211 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | uc_338.20-201 | ENST00000621563 | 178 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DUXAP9-208 | ENST00000622815 | 614 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC011718.1-201 | ENST00000622906 | 375 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC012640.5-201 | ENST00000623897 | 319 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC019226.2-201 | ENST00000625973 | 424 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL157786.1-207 | ENST00000627771 | 695 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC110994.2-201 | ENST00000635481 | 492 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR7157-201 | ENST00000635801 | 60 nt | BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HSFY2-201 | ENST00000304790 | 1444 nt | APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC | 1.97 | □□□□□ -2.09 | | |