Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
VAMP3Q15836 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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