Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NPTX1Q15818 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms