Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
TAF1AQ15573 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms