Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERC3Q15034 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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