Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SHPRHQ149N8 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.33
SHPRHQ149N8 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
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