Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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CKAP5Q14008 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CKAP5Q14008 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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