| RUNX2 | Q13950 | AC025871.1-201 | ENST00000523935 | 443 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR548S-201 | ENST00000581352 | 82 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR5195-201 | ENST00000583555 | 115 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z82243.1-201 | ENST00000609432 | 473 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U1.23-201 | ENST00000610293 | 146 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | uc_338.25-201 | ENST00000613756 | 156 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-68P-201 | ENST00000615382 | 146 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U1.39-201 | ENST00000621562 | 146 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYLC1-202 | ENST00000621735 | 379 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC018692.3-201 | ENST00000623929 | 123 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTRNR2L10-201 | ENST00000545075 | 1530 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SAMD9-201 | ENST00000379958 | 6852 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRB2-201 | ENST00000389362 | 1429 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LPP-221 | ENST00000618621 | 18277 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LPP-222 | ENST00000640853 | 18277 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092435.3-201 | ENST00000565538 | 3654 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003122.5-201 | ENST00000527668 | 3766 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL079305.1-201 | ENST00000623159 | 3008 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BAZ2B-202 | ENST00000343439 | 2364 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CLOCK-201 | ENST00000309964 | 10304 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-266P-201 | ENST00000364225 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CD24P4-201 | ENST00000382840 | 243 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NT5C3A-205 | ENST00000409467 | 1032 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-47P-201 | ENST00000410876 | 114 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC023141.4-201 | ENST00000412031 | 328 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC01201-201 | ENST00000412420 | 294 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2Q2P12-201 | ENST00000414573 | 204 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006028.1-201 | ENST00000438379 | 402 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL863P-201 | ENST00000462370 | 296 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS27P29-201 | ENST00000463110 | 252 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC109925.1-201 | ENST00000478069 | 331 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL504P-201 | ENST00000494496 | 287 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIGD1AP13-201 | ENST00000509878 | 289 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TBCAP3-201 | ENST00000512475 | 312 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA14.1-201 | ENST00000516113 | 141 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA64.4-201 | ENST00000516632 | 81 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008083.3-201 | ENST00000547777 | 329 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PSMA3P-201 | ENST00000555485 | 635 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC037471.2-201 | ENST00000564941 | 598 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097467.3-205 | ENST00000597955 | 594 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL589765.7-201 | ENST00000601684 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355376.2-201 | ENST00000603866 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | YPEL5P2-201 | ENST00000605553 | 359 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ATG5-207 | ENST00000613993 | 733 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DLX6-AS1_1.1-201 | ENST00000621599 | 180 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR4C16-201 | ENST00000623907 | 933 nt | APPRIS P1 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U6.99-201 | ENST00000637524 | 83 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365440.2-201 | ENST00000419738 | 2597 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MYOT-208 | ENST00000515645 | 1578 nt | TSL 2 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FNBP1L-203 | ENST00000370253 | 3889 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTND5P27-201 | ENST00000428871 | 1720 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MS4A14-202 | ENST00000395001 | 3401 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MARCH7-202 | ENST00000409175 | 2402 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PRKG2-206 | ENST00000545647 | 3852 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP139-201 | ENST00000364340 | 117 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA9-201 | ENST00000384215 | 133 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP003170.3-201 | ENST00000399123 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL21P111-201 | ENST00000418453 | 477 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL627311.1-201 | ENST00000431514 | 115 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005160.1-201 | ENST00000432405 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PLCE1-AS2-203 | ENST00000433038 | 396 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136234.1-201 | ENST00000437080 | 349 nt | TSL 2 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC010486.1-201 | ENST00000511793 | 424 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1069P-201 | ENST00000516612 | 133 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP380-201 | ENST00000517190 | 98 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BTF3P12-201 | ENST00000519620 | 469 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC090136.1-201 | ENST00000520009 | 240 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC104211.1-202 | ENST00000521307 | 866 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107953.1-201 | ENST00000522216 | 297 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC091043.1-201 | ENST00000579830 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | U6.42-201 | ENST00000618440 | 107 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ADAMTS9-AS1-207 | ENST00000594810 | 3609 nt | TSL 4 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CDK1-201 | ENST00000316629 | 1733 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC099654.7-201 | ENST00000635788 | 2127 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CCDC30-212 | ENST00000507855 | 2445 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108750.1-201 | ENST00000637986 | 2706 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-105P-201 | ENST00000363470 | 161 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5-8SP4-201 | ENST00000365096 | 150 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.373-201 | ENST00000365600 | 103 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1027P-201 | ENST00000383998 | 107 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MORN2-203 | ENST00000409131 | 544 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ELF3-AS1-201 | ENST00000415582 | 500 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007463.1-201 | ENST00000416534 | 734 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353678.1-201 | ENST00000422735 | 741 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGN2P10-201 | ENST00000448085 | 265 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007547.1-201 | ENST00000462177 | 490 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HMGB1P30-201 | ENST00000492455 | 606 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA74D-201 | ENST00000516404 | 141 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC069120.1-201 | ENST00000521623 | 379 nt | TSL 3 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SARNP-203 | ENST00000552080 | 726 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121579.1-201 | ENST00000555129 | 305 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBL5P2-201 | ENST00000583788 | 219 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107294.3-201 | ENST00000609211 | 526 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL121757.2-201 | ENST00000611223 | 313 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FAM157A-202 | ENST00000615155 | 405 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HIKESHI-208 | ENST00000618164 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC009033.1-201 | ENST00000624279 | 431 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PCNP-208 | ENST00000627393 | 136 nt | TSL 2 BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |