Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GTF2H2Q13888 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms