Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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PKP1Q13835 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
PKP1Q13835 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PKP1Q13835 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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