Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRR1Q13601 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms