Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PKD2Q13563 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 559.4 ms