Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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TUBB3Q13509 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
TUBB3Q13509 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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