Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SMAD4Q13485 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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