Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
TOP3AQ13472 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TOP3AQ13472 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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