Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDAP1Q13442 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDAP1Q13442 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms