Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
AP3B2Q13367 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
AP3B2Q13367 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms