Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CLN3Q13286 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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