Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RPA4Q13156 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms