Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
MKRN3Q13064 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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