Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PRDM2Q13029 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC0.78□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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PRDM2Q13029 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRDM2Q13029 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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