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| TSPAN31 | Q12999 | RNU6-898P-201 | ENST00000365627 | 104 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | KIF27-203 | ENST00000376347 | 1030 nt | TSL 5 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU6-723P-201 | ENST00000383973 | 107 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | MIR30A-201 | ENST00000385092 | 71 nt | BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
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| TSPAN31 | Q12999 | ASPM-202 | ENST00000367408 | 3747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU1-23P-201 | ENST00000363361 | 144 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU4-92P-201 | ENST00000363783 | 136 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL390198.1-201 | ENST00000376445 | 320 nt | TSL 2 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| TSPAN31 | Q12999 | RNU6-166P-201 | ENST00000384371 | 107 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNA5SP465-201 | ENST00000391195 | 109 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL627390.1-201 | ENST00000396055 | 340 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU2-48P-201 | ENST00000410694 | 191 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| TSPAN31 | Q12999 | AC244093.3-201 | ENST00000615419 | 411 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | ZEB2_AS1_1.1-201 | ENST00000621504 | 128 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC017037.3-201 | ENST00000625016 | 472 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | MTND5P42-201 | ENST00000637720 | 498 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL160287.1-202 | ENST00000638113 | 454 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SEMG2-201 | ENST00000372769 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | LINC01684-201 | ENST00000415182 | 2176 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | CENPQ-201 | ENST00000335783 | 1733 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SNORA4.1-201 | ENST00000364263 | 144 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SNORA4.3-201 | ENST00000365564 | 137 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SMIM11P1-201 | ENST00000369586 | 178 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SNORA75B-201 | ENST00000384053 | 137 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU6ATAC2P-201 | ENST00000387943 | 126 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | RNU6-1242P-201 | ENST00000391052 | 103 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL133475.1-201 | ENST00000404414 | 305 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | MIR1304-201 | ENST00000408243 | 91 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC007098.1-201 | ENST00000420122 | 367 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC016710.1-201 | ENST00000421326 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL589986.2-201 | ENST00000429352 | 397 nt | TSL 2 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | ZNF736P11Y-201 | ENST00000442535 | 1213 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC118469.1-201 | ENST00000442943 | 488 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AF129075.1-201 | ENST00000457162 | 794 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | CPHL1P-203 | ENST00000471823 | 523 nt | TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC110767.1-201 | ENST00000508374 | 239 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AC117460.1-201 | ENST00000508964 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | Y_RNA.675-201 | ENST00000516389 | 149 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | SNORA31.19-201 | ENST00000517079 | 126 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | CD44-AS1-201 | ENST00000528869 | 587 nt | TSL 4 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AP000907.2-201 | ENST00000530827 | 353 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
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| TSPAN31 | Q12999 | AL355076.2-202 | ENST00000553754 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | LINC01899-202 | ENST00000583756 | 575 nt | TSL 3 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL391813.2-201 | ENST00000609113 | 322 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | AL365204.3-201 | ENST00000612448 | 685 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| TSPAN31 | Q12999 | TMEM154-204 | ENST00000613578 | 486 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |