Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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BNIP1Q12981 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BNIP1Q12981 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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