Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
POU5F1Q01860 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms