Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXA13P31271 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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