Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRAP18433 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms