Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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