Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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LHX9Q9NQ69 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LHX9Q9NQ69 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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