Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAPPC9Q96Q05 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms