Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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CCDC47Q96A33 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC47Q96A33 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC47Q96A33 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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