Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF548Q8NEK5 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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