Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB6CQ53S08 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB6CQ53S08 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms