Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
ANKRD39Q53RE8 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ANKRD39Q53RE8 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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