Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC142Q17RM4 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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