Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
IMPG1Q17R60 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IMPG1Q17R60 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms