Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CLPPQ16740 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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