Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SGCBQ16585 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.2 ms