Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
DDB1Q16531 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDB1Q16531 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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