Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNXAQ16473 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms