Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CNGA3Q16281 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CNGA3Q16281 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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