Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATP6AP1Q15904 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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