| ATP6AP1 | Q15904 | SATB1-AS1-227 | ENST00000625533 | 743 nt | TSL 5 BASIC | 2.01 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | EDDM3A-201 | ENST00000326842 | 927 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.33-201 | ENST00000362591 | 102 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNY4P34-201 | ENST00000364779 | 95 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-169P-201 | ENST00000365336 | 107 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA20.2-201 | ENST00000383922 | 131 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA24.1-201 | ENST00000384401 | 135 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR196B-201 | ENST00000384852 | 84 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-195P-201 | ENST00000411352 | 109 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC127391.1-201 | ENST00000411737 | 98 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP000473.1-201 | ENST00000413645 | 550 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND2P18-201 | ENST00000419962 | 1030 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009299.3-201 | ENST00000421122 | 1072 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL512656.1-201 | ENST00000427492 | 401 nt | TSL 2 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01817-201 | ENST00000429317 | 564 nt | TSL 4 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Z98742.2-201 | ENST00000431564 | 187 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PCYT1B-AS1-201 | ENST00000432626 | 275 nt | TSL 2 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MICF-203 | ENST00000432679 | 129 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OPA1-AS1-201 | ENST00000433105 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KCNJ6-AS1-201 | ENST00000435001 | 357 nt | TSL 5 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC069549.1-201 | ENST00000451584 | 499 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ANKRD62P1-PARP4P3-201 | ENST00000456726 | 1181 nt | TSL 5 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC090515.1-201 | ENST00000465295 | 476 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC117386.2-202 | ENST00000472821 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022493.1-201 | ENST00000492984 | 337 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC023194.1-201 | ENST00000493084 | 308 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC097462.2-201 | ENST00000504623 | 481 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AKIRIN2P1-201 | ENST00000505898 | 352 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC023141.11-201 | ENST00000508864 | 202 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-123P-201 | ENST00000516163 | 102 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SCARNA24.1-201 | ENST00000516465 | 137 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008741.1-201 | ENST00000569456 | 510 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR3935-201 | ENST00000583472 | 104 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC002984.1-201 | ENST00000591692 | 448 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZNF788-206 | ENST00000596883 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL021997.1-201 | ENST00000605757 | 193 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC012409.4-201 | ENST00000612923 | 249 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL133173.2-201 | ENST00000614270 | 90 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008250.2-201 | ENST00000615261 | 205 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL359547.2-201 | ENST00000615810 | 418 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC024940.5-201 | ENST00000622889 | 474 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SEC23A-215 | ENST00000625395 | 261 nt | TSL 5 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMHB1-202 | ENST00000638299 | 126 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZBBX-205 | ENST00000455345 | 3185 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KBTBD3-207 | ENST00000534815 | 3396 nt | TSL 5 BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TEX21P-201 | ENST00000447107 | 1476 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC103710.2-202 | ENST00000641454 | 2853 nt | BASIC | 2 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008163.1-205 | ENST00000413944 | 4649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA5B-201 | ENST00000363786 | 132 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-1280P-201 | ENST00000365211 | 107 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-641P-201 | ENST00000384006 | 107 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR221-201 | ENST00000385135 | 110 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR147B-201 | ENST00000390185 | 80 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA40.3-201 | ENST00000390964 | 122 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL049545.1-201 | ENST00000401856 | 572 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-39P-201 | ENST00000410604 | 198 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-8P-201 | ENST00000410727 | 190 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL031779.1-201 | ENST00000415663 | 330 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02331-201 | ENST00000418927 | 602 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL356277.2-201 | ENST00000421318 | 441 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC013401.1-202 | ENST00000422017 | 626 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | U51244.1-201 | ENST00000423120 | 374 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL109947.1-201 | ENST00000423747 | 382 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL30P4-201 | ENST00000429309 | 333 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL135908.1-201 | ENST00000431394 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355340.1-201 | ENST00000433085 | 344 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC112518.1-201 | ENST00000436089 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | FABP5P14-201 | ENST00000437273 | 393 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | BTF3P15-201 | ENST00000455606 | 336 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNRPGP9-201 | ENST00000456025 | 225 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNRPFP4-201 | ENST00000456366 | 242 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS3P1-201 | ENST00000456781 | 192 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS27P21-201 | ENST00000486977 | 252 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC079943.2-201 | ENST00000488999 | 716 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092608.1-201 | ENST00000503505 | 267 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC093292.1-201 | ENST00000505050 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND4P2-201 | ENST00000507767 | 1203 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC02064-202 | ENST00000507876 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS3A-208 | ENST00000509736 | 576 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR514B-201 | ENST00000516774 | 80 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ACA59.2-201 | ENST00000517061 | 156 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SCARNA3-201 | ENST00000517097 | 143 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC103794.1-201 | ENST00000531763 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010186.2-204 | ENST00000537668 | 439 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GTF3AP2-201 | ENST00000557014 | 266 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC141273.1-201 | ENST00000565300 | 479 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPS3AP23-202 | ENST00000574601 | 686 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DEFB131E-202 | ENST00000602581 | 683 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009314.1-201 | ENST00000603871 | 304 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | APOOP1-201 | ENST00000604695 | 592 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL022154.1-201 | ENST00000604698 | 785 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL121992.2-201 | ENST00000606262 | 256 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OR2AS2P-201 | ENST00000606902 | 342 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | uc_338.14-201 | ENST00000613162 | 166 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR6817-201 | ENST00000615588 | 66 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL449363.1-201 | ENST00000617815 | 186 nt | BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SHOC2-201 | ENST00000265277 | 3691 nt | TSL 2 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PARPBP-203 | ENST00000392911 | 1916 nt | TSL 5 BASIC | 1.99 | □□□□□ -2.09 | | |