Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHRNA6Q15825 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHRNA6Q15825 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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